Čes-slov Pediat 2025, 80(2):87-96 | DOI: 10.55095/CSPediatrie2024/064
Střevní mikrobiom novorozence
- 1 Dětská klinika, Fakultní nemocnice Hradec Králové, Lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Hradci Králové
- 2 Ústav klinické mikrobiologie, Fakultní nemocnice, Lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Hradci Králové
Střevní mikrobiom je právem označovaný jako neviditelný orgán, který významně ovlivňuje lidský organismus po celý jeho život. Procesů, na kterých se podílí, je mnoho. Kromě dobře známé role v oblasti trávení dále ovlivňuje maturaci imunitního
systému, metabolické programování a propojuje i poměrně vzdálené orgány (např. osa střevo-mozek). Vývoj střevního mikrobiomu začíná záhy po narození a působící faktory můžeme rozdělit na modifikovatelné (výživa, antibiotická léčba, prostředí) a neovlivnitelné (gestační stáří, způsob porodu). Alterace střevního mikrobiomu těmito faktory je spojována jak s krátkodobou, tak dlouhodobou morbiditou.
Cílem současného výzkumu je porozumět nejen vývoji samotnému, ale i všem činitelům, které mohou do tohoto přirozeného procesu zasahovat. Poznání a pochopení komplexity střevního mikrobiomu nám umožní činit taková medicínská rozhodnutí, která budou mít pro novorozence značné benefity. Tento přehledový článek přináší vhled do problematiky vzniku a vývoje střevního mikrobiomu a s tím spojené možné
klinické aspekty u donošeného i nedonošeného novorozence. Součástí našeho sdělení jsou i doporučení, která vycházejí ze současného poznání, k ovlivnění negativních následků alterace střevního mikrobiomu v tomto křehkém období.
Klíčová slova: mikrobiom, střevní mikrobiom, novorozenec, nezralost, kojení, antibiotika, císařský řez
Vloženo: 15. říjen 2024; Revidováno: 13. listopad 2024; Přijato: 4. prosinec 2024; Zveřejněno: 20. květen 2025 Zobrazit citaci
Reference
- . Berg G, et al. Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges. Microbiome 2020; 8(1): 103.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Walters KE, Martiny JBH. Alpha-, beta-, and gamma-diversity of bacteria varies across habitats. PLoS One 2020; 15(9): e0233872.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Le Chatelier E, et al. Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers. Nature 2013; 500(7464): 541-6.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Tamboli CP, et al. Dysbiosis in inflammatory bowel disease. Gut 2004. 53(1): 1-4.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Salvucci E. Microbiome, holobiont and the net of life. Crit Rev Microbiol 2016; 42(3): 485-94.
- . Kasarello K. Cudnoch-Jedrzejewska A, Czarzasta K. Communication of gut microbiota and brain via immune and neuroendocrine signaling. Front Microbiol 2023; 14: 1118529.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Fung TC, Olson CA, Hsiao EY. Interactions between the microbiota, immune and nervous systems in health and disease. Nat Neurosci 2017; 20(2): 145-155.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Česká mikrobiomová společnost. Stanovisko výboru ČMS, vymezení pojmů. Available from: https://www.mikrobiom-cms.cz/stanoviska-cms/analyza-mikrobiomu-uvod-do-problematiky/
- . Stinson LF, et al. The not-so-sterile womb: evidence that the human fetus is exposed to bacteria prior to birth. Front Microbiol 2019; 10: 1124.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Aagaard K, et al. The placenta harbors a unique microbiome. Sci Transl Med 2014; 6(237): 237ra65.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Collado MC, et al. Human gut colonisation may be initiated in utero by distinct microbial communities in the placenta and amniotic fluid. Sci Rep 2016; 6: 23129.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Wilczyńska P, Skarżyńska E, Lisowska-Myjak B. Meconium microbiome as a new source of information about long-term health and disease: questions and answers. J Matern Fetal Neonatal Med 2019; 32(4): 681-686.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Kennedy KM, et al. Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies. Nature 2023; 613(7945): 639-649.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Liu Y, et al. Midtrimester amniotic fluid from healthy pregnancies has no microorganisms using multiple methods of microbiologic inquiry. Am J Obstet Gynecol 2020; 223(2): 248.e1-248.e21.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . de Goffau MC, et al. Human placenta has no microbiome but can contain potential pathogens. Nature 2019; 572(7769): 329-334.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Kuperman AA, et al. Deep microbial analysis of multiple placentas shows no evidence for a placental microbiome. Bjog 2020; 127(2): 159-169.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Sterpu I, et al. No evidence for a placental microbiome in human pregnancies at term. Am J Obstet Gynecol 2021; 224(3): 296.e1-296.e23.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Healy DB, et al. Clinical implications of preterm infant gut microbiome development. Nat Microbiol 2022; 7(1): 22-33.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Singh A, Mittal M. Neonatal microbiome - a brief review. J Matern Fetal Neonatal Med 2020; 33(22): 3841-3848.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Gómez-Martín M, et al. Association between diet and fecal microbiota along the first year of life. Food Res Int 2022; 162(Pt A): 111994.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Bäckhed F, et al. Dynamics and stabilization of the human gut microbiome during the first year of life. Cell Host Microbe 2015; 17(5): 690-703.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Davis EC, Wang M, Donovan SM. The role of early life nutrition in the establishment of gastrointestinal microbial composition and function. Gut Microbes 2017; 8(2): 143-171.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Laursen MF, et al. Infant gut microbiota development is driven by transition to family foods independent of maternal obesity. mSphere 2016; 1(1).
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Chambers ES, et al. Role of gut microbiota-generated short-chain fatty acids in metabolic and cardiovascular health. Curr Nutr Rep 2018; 7(4): 198-206.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Hill CJ, et al. Evolution of gut microbiota composition from birth to 24 weeks in the INFANTMET Cohort. Microbiome 2017; 5(1): 4.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Maher SE, et al. The association between the maternal diet and the maternal and infant gut microbiome: a systematic review. Br J Nutr 2020: 1-29.
- . Shaterian N, et al. Role of cesarean section in the development of neonatal gut microbiota: A systematic review. Open Med (Wars) 2021; 16(1): 624-639.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Green ES, Arck PC. Pathogenesis of preterm birth: bidirectional inflammation in mother and fetus. Semin Immunopathol 2020; 42(4): 413-429.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Dierikx TH, et al. The influence of prenatal and intrapartum antibiotics on intestinal microbiota colonisation in infants: A systematic review. J Infect 2020; 81(2): 190-204.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Rodriguez J, et al. The neonatal microbiome: implications for Neonatal Intensive Care Unit nurses. MCN Am J Matern Child Nurs 2017; 42(6): 332-337.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Blekhman R, et al. Host genetic variation impacts microbiome composition across human body sites. Genome Biol 2015; 16(1): 191.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Koren O, et al. Host remodeling of the gut microbiome and metabolic changes during pregnancy. Cell 2012; 150(3): 470-80.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Chu DM, et al. The early infant gut microbiome varies in association with a maternal high-fat diet. Genome Med 2016; 8(1): 77.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Lundgren SN, et al. Maternal diet during pregnancy is related with the infant stool microbiome in a delivery mode-dependent manner. Microbiome 2018; 6(1): 109.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Fan HY, et al. Maternal vegetable and fruit consumption during pregnancy and its effects on infant gut microbiome. Nutrients 2021; 13(5).
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Laforest-Lapointe I, et al. Maternal consumption of artificially sweetened beverages during pregnancy is associated with infant gut microbiota and metabolic modifications and increased infant body mass index. Gut Microbes 2021; 13(1): 1-15.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Babakobi MD, et al. Effect of maternal diet and milk lipid composition on the infant gut and maternal milk microbiomes. Nutrients 2020; 12(9).
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Shao Y, et al. Stunted microbiota and opportunistic pathogen colonization in caesarean-section birth. Nature 2019; 574(7776): 117-121.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Sakwinska O, et al. Does the maternal vaginal microbiota play a role in seeding the microbiota of neonatal gut and nose? Benef Microbes 2017; 8(5): 763-778.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Ferretti P, et al. Mother-to-infant microbial transmission from different body sites shapes the developing infant gut microbiome. Cell Host Microbe 2018; 24(1): 133-145.e5.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Korpela K, et al. Selective maternal seeding and environment shape the human gut microbiome. Genome Res 2018; 28(4): 561-568.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Reyman M, et al. Impact of delivery mode-associated gut microbiota dynamics on health in the first year of life. Nat Commun 2019; 10(1): 4997.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Yang W, et al. Ongoing supplementation of probiotics to Cesarean-born neonates during the first month of life may impact the gut microbial. Am J Perinatol 2021; 38(11): 1181-1191.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Milani C, et al. The first microbial colonizers of the human gut: composition, activities, and health implications of the infant gut microbiota. Microbiol Mol Biol Rev 2017; 81(4).
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Carlson AL, et al. Infant gut microbiome associated with cognitive development. Biol Psychiatry 2018; 83(2): 148-159.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Parra-Llorca A, et al. Preterm gut microbiome depending on feeding type: significance of donor human milk. Front Microbiol 2018; 9: 1376.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Lyons KE, et al. Breast milk, a source of beneficial microbes and associated benefits for infant health. Nutrients 2020; 12(4).
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Granger CL, et al. Maternal breastmilk, infant gut microbiome and the impact on preterm infant health. Acta Paediatr 2021; 110(2): 450-457.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Miura K, et al. Comparison of bacterial profiles in human milk from mothers of term and preterm infants. Int Breastfeed J 2023; 18(1): 29.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Chu DM, et al. The development of the human microbiome: why moms matter. Gastroenterol Clin North Am 2019; 48(3): 357-375.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Rodríguez JM. The origin of human milk bacteria: is there a bacterial entero-mammary pathway during late pregnancy and lactation? Adv Nutr 2014; 5(6): 779-84.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Breastfeeding and the use of human milk. Pediatrics 2012; 129(3): e827-41.
- . Olin A, et al. Stereotypic immune system development in newborn children. Cell 2018; 174(5): 1277-1292.e14.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Embleton ND, et al. Effect of an exclusive human milk diet on the gut microbiome in preterm infants: a randomized clinical trial. JAMA Netw Open 2023; 6(3): e231165.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Quigley M, et al. Formula versus donor breast milk for feeding preterm or low birth weight infants. Cochrane Database Syst Rev 2018; 6(6): Cd002971.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Ledger WJ, et al. Are we using too many antibiotics during pregnancy? Bjog 2013; 120(12): 1450-2.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Nogacka A, et al. Impact of intrapartum antimicrobial prophylaxis upon the intestinal microbiota and the prevalence of antibiotic resistance genes in vaginally delivered full-term neonates. Microbiome 2017; 5(1): 93.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Corvaglia L, et al. Influence of intrapartum antibiotic prophylaxis for group b streptococcus on gut microbiota in the first month of life. J Pediatr Gastroenterol Nutr 2016; 62(2): 304-8.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Aronoff DM, et al. Disturbing the neonatal microbiome is a small price to pay for preventing early-onset neonatal group B streptococcus disease: AGAINST: Against relying on antibiotics to prevent early-onset neonatal group B streptococcus disease. Bjog 2020; 127(2): 229.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Zou ZH, et al. Prenatal and postnatal antibiotic exposure influences the gut microbiota of preterm infants in neonatal intensive care units. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2018; 17(1): 9.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Russell JT, et al. Antibiotics and the developing intestinal microbiome, metabolome and inflammatory environment in a randomized trial of preterm infants. Sci Rep 2021; 11(1): 1943.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Korpela K, et al. Probiotic supplementation restores normal microbiota composition and function in antibiotic-treated and in caesarean-born infants. Microbiome 2018; 6(1): 182.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Parm U, et al. Risk factors associated with gut and nasopharyngeal colonization by common Gram-negative species and yeasts in neonatal intensive care units patients. Early Hum Dev 2011; 87(6): 391-9.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Brooks B, et al. Microbes in the neonatal intensive care unit resemble those found in the gut of premature infants. Microbiome 2014; 2(1): 1.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Wiedermannová H, Zárubová P, Adámková V. Ceftazidim/avibactam v léčbě gramnegativní nozokomiální sepse u nezralého novorozence. Pediatr praxi 2020; 21(6): 426-428.
Přejít k původnímu zdroji...
- . Flandroy L, et al. The impact of human activities and lifestyles on the interlinked microbiota and health of humans and of ecosystems. Sci Total Environ 2018; 627: 1018-1038.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Azad MB, et al. Infant gut microbiota and the hygiene hypothesis of allergic disease: impact of household pets and siblings on microbiota composition and diversity. Allergy Asthma Clin Immunol 2013; 9(1): 15.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Laursen MF, et al. Having older siblings is associated with gut microbiota development during early childhood. BMC Microbiol 2015; 15: 154.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Tun HM, et al. Exposure to household furry pets influences the gut microbiota of infant at 3-4 months following various birth scenarios. Microbiome 2017; 5(1): 40.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Nermes M, et al. Furry pets modulate gut microbiota composition in infants at risk for allergic disease. J Allergy Clin Immunol 2015; 136(6): 1688-1690.e1.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Wegienka G, et al. Subgroup differences in the associations between dog exposure during the first year of life and early life allergic outcomes. Clin Exp Allergy 2017; 47(1): 97-105.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Brugman S, et al. Mucosal immune development in early life: setting the stage. Arch Immunol Ther Exp (Warsz) 2015; 63(4): 251-68.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Thorburn AN, et al. Evidence that asthma is a developmental origin disease influenced by maternal diet and bacterial metabolites. Nat Commun 2015; 6: 7320.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Sanidad KZ, Zeng MY. Neonatal gut microbiome and immunity. Curr Opin Microbiol 2020; 56: 30-37.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Kollmann TR, et al. Innate immune function by Toll-like receptors: distinct responses in newborns and the elderly. Immunity 2012; 37(5): 771-83.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Barnes MJ, Powrie F. Regulatory T cells reinforce intestinal homeostasis. Immunity 2009; 31(3): 401-11.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Atarashi K, et al. Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota. Nature 2013; 500(7461): 232-6.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Cahenzli J, et al. Intestinal microbial diversity during early-life colonization shapes long-term IgE levels. Cell Host Microbe 2013; 14(5): 559-70.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . World and H.O.O.a.o.A.a.h. www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight
- . Sanchez M, Panahi S, Tremblay A. Childhood obesity: a role for gut microbiota? Int J Environ Res Public Health 2014; 12(1): 162-75.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Schwiertz A, et al. Microbiota and SCFA in lean and overweight healthy subjects. Obesity (Silver Spring) 2010; 18(1): 190-5.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Ley RE, et al. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature 2006; 444(7122): 1022-3.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Cho KY. Lifestyle modifications result in alterations in the gut microbiota in obese children. BMC Microbiol 2021; 21(1): 10.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Sonnenburg JL, et al. Glycan foraging in vivo by an intestine-adapted bacterial symbiont. Science 2005; 307(5717): 1955-9.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Murugesan S, et al. Gut microbiome production of short-chain fatty acids and obesity in children. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2018; 37(4): 621-625.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Jumpertz R, et al. Energy-balance studies reveal associations between gut microbes, caloric load, and nutrient absorption in humans. Am J Clin Nutr 2011; 94(1): 58-65.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . De Filippo C, et al. Impact of diet in shaping gut microbiota revealed by a comparative study in children from Europe and rural Africa. Proc Natl Acad Sci U S A 2010; 107(33): 14691-6.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Cox LM, Blaser MJ. Pathways in microbe-induced obesity. Cell Metab 2013; 17(6): 883-894.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Dawson-Hahn EE, Rhee KE. The association between antibiotics in the first year of life and child growth trajectory. BMC Pediatr 2019; 19(1): 23.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Mihi B, Good M. Impact of Toll-like receptor 4 signaling in necrotizing enterocolitis: the state of the science. Clin Perinatol 2019; 46(1): 145-157.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Stewart CJ, et al. Temporal bacterial and metabolic development of the preterm gut reveals specific signatures in health and disease. Microbiome 2016; 4(1): 67.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Boráková K. Aktuální diagnostická kritéria neonatální sepse a systémové zánětlivé odpovědi u plodu a novorozence Čes-slov Pediat 2021; 76 (1): 46-54.
- . Stewart CJ, et al. Longitudinal development of the gut microbiome and metabolome in preterm neonates with late onset sepsis and healthy controls. Microbiome 2017; 5(1): 75.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Kersbergen KJ, et al. Microstructural brain development between 30 and 40 weeks corrected age in a longitudinal cohort of extremely preterm infants. Neuroimage 2014; 103: 214-224.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Nongena P, et al. Confidence in the prediction of neurodevelopmental outcome by cranial ultrasound and MRI in preterm infants. Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed 2010; 95(6): F388-90.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Kuban KCK, et al. Among children born extremely preterm a higher level of circulating neurotrophins is associated with lower risk of cognitive impairment at school age. J Pediatr 2018; 201: 40-48.e4.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
- . Morland C, et al. Propionate enters GABAergic neurons, inhibits GABA transaminase, causes GABA accumulation and lethargy in a model of propionic acidemia. Biochem J 2018; 475(4): 749-758.
Přejít k původnímu zdroji...
Přejít na PubMed...
Tento článek je publikován v režimu tzv. otevřeného přístupu k vědeckým informacím (Open Access), který je distribuován pod licencí Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0), která umožňuje distribuci, reprodukci a změny, pokud je původní dílo řádně ocitováno. Není povolena distribuce, reprodukce nebo změna, která není v souladu s podmínkami této licence.